19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2760 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2760  Ig domain-containing protein  100 
 
 
670 aa  1338    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  30 
 
 
614 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  29.37 
 
 
845 aa  183  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0821  Ig domain-containing protein  29.01 
 
 
609 aa  173  9e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0946552  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2924  Ig-like, group 1  29.98 
 
 
633 aa  164  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  26.7 
 
 
727 aa  144  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1988  Ig-like, group 1  25 
 
 
667 aa  110  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3402  hypothetical protein  29.17 
 
 
562 aa  79.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.677203 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0328  Ig domain-containing protein  28.38 
 
 
830 aa  65.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.979457  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5576  hypothetical protein  25.52 
 
 
535 aa  57  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101145  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  26.16 
 
 
1746 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  24.94 
 
 
1084 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0553  von Willebrand factor, type A  30.85 
 
 
1002 aa  45.8  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253544  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0127  von Willebrand factor, type A  29.2 
 
 
1081 aa  45.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  27.88 
 
 
2367 aa  45.4  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  27.88 
 
 
2383 aa  45.4  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  27.88 
 
 
2358 aa  45.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  28.92 
 
 
2358 aa  44.7  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  28.92 
 
 
2296 aa  44.7  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>