12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1260 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1260  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0667  hypothetical protein  51.65 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.930105  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  27.78 
 
 		 3921 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  28.17 
 
 		 2573 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  27.52 
 
 		 744 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  29.94 
 
 		 1989 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  31.1 
 
 		 983 aa  52.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  30.83 
 
 		 726 aa  49.3  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4916  hypothetical protein  33.06 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1332 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  28.37 
 
 		 1293 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2970  hypothetical protein  37.74 
 
 		 167 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0032208  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>