23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1927 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1927  hypothetical protein  100 
 
 
2748 aa  5592    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4484  hypothetical protein  22.9 
 
 
1372 aa  116  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.517652  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  27.5 
 
 
2573 aa  75.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  24.39 
 
 
3921 aa  69.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  30.87 
 
 
1989 aa  68.6  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  25.24 
 
 
744 aa  65.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  30.47 
 
 
1293 aa  64.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2969  hypothetical protein  24.32 
 
 
574 aa  57.4  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.070385  hitchhiker  0.0000379477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4283  metallophosphoesterase  34.29 
 
 
717 aa  54.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227058  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  30.77 
 
 
3197 aa  52.8  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  25.88 
 
 
1227 aa  53.1  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  29.65 
 
 
6276 aa  52.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  28.66 
 
 
3471 aa  50.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1664  hypothetical protein  47.37 
 
 
696 aa  49.7  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  30.53 
 
 
726 aa  48.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  28.91 
 
 
440 aa  48.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  24.82 
 
 
1537 aa  47.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  31.07 
 
 
3634 aa  47.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4180  conserved repeat domain protein  26.83 
 
 
990 aa  47.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.245505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  24.57 
 
 
1519 aa  47  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  24.24 
 
 
1168 aa  46.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0886  hypothetical protein  40.3 
 
 
827 aa  46.6  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  24.62 
 
 
1059 aa  46.6  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>