26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05444 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001507  MSHA biogenesis protein MshQ  61.65 
 
 		 1008 aa  1056    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101461  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05444  hypothetical protein  100 
 
 		 793 aa  1656    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03686  hypothetical protein  35.94 
 
 		 1544 aa  403  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002382  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1508 aa  184  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  25.9 
 
 		 1072 aa  80.1  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0573  MSHA biogenesis protein MshQ  25.05 
 
 		 1258 aa  72  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0117136  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  23.99 
 
 		 1257 aa  66.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00263  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshQ (pilus type IV)  23.15 
 
 		 1168 aa  63.9  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  22.42 
 
 		 1553 aa  63.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0521  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1543 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.402104 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  26.62 
 
 		 1306 aa  57  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1504 aa  57  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3823  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1541 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.473732  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  22.78 
 
 		 1255 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0517  hypothetical protein  22.29 
 
 		 1543 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0496  hypothetical protein  22.24 
 
 		 1543 aa  51.6  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0848067  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  22.27 
 
 		 1248 aa  51.2  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  22.03 
 
 		 907 aa  50.8  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4403  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1463 aa  48.9  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0182  CUB domain-containing protein  23.9 
 
 		 1537 aa  48.1  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1532 aa  48.1  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  22.36 
 
 		 1261 aa  48.1  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0557  MSHA biogenesis protein MshQ  22.38 
 
 		 906 aa  48.1  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0109211  normal  0.590942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  53.66 
 
 		 1576 aa  46.6  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0402  MSHA biogenesis protein MshQ  20.04 
 
 		 900 aa  46.6  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0473177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2833  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1252 aa  44.3  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000270915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>