26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001507 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001507  MSHA biogenesis protein MshQ  100 
 
 		 1008 aa  2102    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101461  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05444  hypothetical protein  61.65 
 
 		 793 aa  1056    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03686  hypothetical protein  37.35 
 
 		 1544 aa  415  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002382  hypothetical protein  32.65 
 
 		 1508 aa  185  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05445  hypothetical protein  32.14 
 
 		 210 aa  105  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  25.09 
 
 		 1072 aa  91.3  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0573  MSHA biogenesis protein MshQ  25.96 
 
 		 1258 aa  81.3  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0117136  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1504 aa  72.4  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  23.04 
 
 		 1257 aa  68.6  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  25.94 
 
 		 1255 aa  65.1  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  25 
 
 		 1248 aa  64.7  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0402  MSHA biogenesis protein MshQ  21.91 
 
 		 900 aa  62.4  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0473177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  25.84 
 
 		 1261 aa  62.4  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1532 aa  61.6  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4403  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1463 aa  58.5  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  21.98 
 
 		 1306 aa  57.4  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0496  hypothetical protein  23.14 
 
 		 1543 aa  57  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0848067  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0517  hypothetical protein  22.94 
 
 		 1543 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3755  PA14 domain-containing protein  22.59 
 
 		 1382 aa  56.2  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111574  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1553 aa  55.1  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00263  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshQ (pilus type IV)  23.06 
 
 		 1168 aa  54.7  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0466  MSHA biogenesis protein MshQ  23.48 
 
 		 837 aa  53.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0264284  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3823  hypothetical protein  28 
 
 		 1541 aa  47.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.473732  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1576 aa  47.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0521  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1543 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.402104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0557  MSHA biogenesis protein MshQ  25.16 
 
 		 906 aa  45.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0109211  normal  0.590942 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>