212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1734 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1734  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
570 aa  1141    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.055042 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.4 
 
 
859 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.47 
 
 
860 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.32 
 
 
718 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.82 
 
 
713 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.02 
 
 
839 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.98 
 
 
1155 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.29 
 
 
818 aa  101  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.34 
 
 
988 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.16 
 
 
784 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  36.65 
 
 
619 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.6 
 
 
1022 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.62 
 
 
479 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.16 
 
 
1056 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
708 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.03 
 
 
629 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
1056 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.93 
 
 
778 aa  94.4  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.9 
 
 
495 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.27 
 
 
501 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.34 
 
 
490 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  28.47 
 
 
971 aa  90.9  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.47 
 
 
971 aa  90.9  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  28.88 
 
 
500 aa  90.5  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.8 
 
 
478 aa  88.2  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.13 
 
 
515 aa  87  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.28 
 
 
472 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.66 
 
 
502 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  32.53 
 
 
499 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.34 
 
 
499 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.44 
 
 
445 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.67 
 
 
728 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.4 
 
 
485 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.52 
 
 
766 aa  80.9  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  28.89 
 
 
449 aa  80.9  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.55 
 
 
680 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  25.74 
 
 
486 aa  80.5  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.65 
 
 
421 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  26.36 
 
 
477 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  27.63 
 
 
961 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.4 
 
 
649 aa  78.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.32 
 
 
479 aa  78.2  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.76 
 
 
554 aa  77.8  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  26.34 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  29.44 
 
 
482 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 
497 aa  76.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  26.34 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.16 
 
 
489 aa  73.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  28.1 
 
 
576 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.86 
 
 
502 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  29.89 
 
 
527 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.9 
 
 
485 aa  70.9  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  28.36 
 
 
685 aa  70.5  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  28.37 
 
 
1402 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.29 
 
 
522 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  26.51 
 
 
518 aa  68.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  25.71 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.84 
 
 
553 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.24 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2666  Sel1 domain-containing protein  28.84 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0163222  normal  0.379262 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  26.7 
 
 
490 aa  66.6  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.69 
 
 
511 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.96 
 
 
798 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  27.68 
 
 
684 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  27.54 
 
 
490 aa  65.1  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.24 
 
 
528 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  29.17 
 
 
264 aa  65.1  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  26.89 
 
 
831 aa  65.1  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  23.61 
 
 
1493 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  25.36 
 
 
373 aa  64.7  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  31.67 
 
 
472 aa  64.3  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.4 
 
 
343 aa  64.3  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.78 
 
 
288 aa  63.9  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.89 
 
 
295 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.56 
 
 
541 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.17 
 
 
915 aa  62.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.93 
 
 
321 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.3 
 
 
292 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.43 
 
 
824 aa  61.2  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.67 
 
 
255 aa  60.8  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  27.95 
 
 
359 aa  60.5  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  24.33 
 
 
276 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.31 
 
 
360 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  31.06 
 
 
287 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.47 
 
 
652 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530037  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  27.44 
 
 
489 aa  58.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.98 
 
 
504 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3674  enhanced entry protein  25.57 
 
 
540 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  26.92 
 
 
523 aa  59.3  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  38.04 
 
 
315 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.33 
 
 
813 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.78 
 
 
474 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  26.05 
 
 
838 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  29.58 
 
 
346 aa  58.9  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.85 
 
 
652 aa  58.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.7 
 
 
291 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  26.85 
 
 
393 aa  58.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  25 
 
 
235 aa  57.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  27.05 
 
 
789 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  26.92 
 
 
337 aa  57.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>