80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1416 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 253 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1171  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  80.4 
 
 		 255 aa  390  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.208534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3469  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  63.48 
 
 		 255 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1812  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  62.07 
 
 		 253 aa  274  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0650  putative serine protease  58.7 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1979  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  61.64 
 
 		 234 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2105  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  58.19 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000698291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3157  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.11 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0408273  hitchhiker  0.0067091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4174  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.59 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1429  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.91 
 
 		 251 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.321686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4968  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.61 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4967  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.71 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147965 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1703  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.87 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333064  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0432  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.28 
 
 		 248 aa  92.8  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.903752 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4440  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.32 
 
 		 290 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1704  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.48 
 
 		 282 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204445  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1426  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.71 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1430  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.48 
 
 		 297 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.973827  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.03 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1425  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.02 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.262697 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4439  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.46 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0387743  normal  0.991895 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49772  predicted protein  29.22 
 
 		 582 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1254  putative trypsin  27.03 
 
 		 548 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000770222  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2873  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.28 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0332194  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.73 
 
 		 841 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.15 
 
 		 843 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0425  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.78 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3037  peptidase M7 snapalysin  30.29 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54319  predicted protein  25.82 
 
 		 607 aa  56.2  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2189  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.35 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.102691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3593  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.09 
 
 		 650 aa  55.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37254  predicted protein  29.1 
 
 		 399 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2825  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.23 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01372  hypothetical protein  25.21 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5572  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.67 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.91 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  hitchhiker  0.0000000383198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2926  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.6 
 
 		 427 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190852  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5818  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.81 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004097  secreted trypsin-like serine protease  27.18 
 
 		 538 aa  52  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000141932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  33.5 
 
 		 713 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2723  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.51 
 
 		 552 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547831  normal  0.0221435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.43 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1113  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.88 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10090  secreted trypsin-like serine protease  29.13 
 
 		 262 aa  48.9  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.811514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5869  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.63 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1830  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.05 
 
 		 465 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0820  putative trypsin  27.68 
 
 		 403 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000898339  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04979  elastase  25.22 
 
 		 333 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2499  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.64 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.8152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8717  hypothetical protein  27.31 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0055  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.19 
 
 		 416 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3349  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.44 
 
 		 732 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.185499  hitchhiker  0.0040915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3119  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.28 
 
 		 732 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449622  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5018  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.67 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0219219  normal  0.251525 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0600  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.73 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.1 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.48 
 
 		 474 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49602  predicted protein  26.37 
 
 		 558 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4609  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.43 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6818  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.93 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.625303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0149  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.19 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2893  hypothetical protein  29.35 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0812422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0723  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.38 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1987  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.56 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.95 
 
 		 557 aa  46.2  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1860  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.56 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.688645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1788  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.82 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.04 
 
 		 494 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5451  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.36 
 
 		 338 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal  0.239065 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001191  secreted trypsin-like serine protease  22.92 
 
 		 379 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40462  predicted protein  25.91 
 
 		 508 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.1729  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5497  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.11 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000909989  normal  0.722104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3882  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.73 
 
 		 511 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5959  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.82 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252451  normal  0.94497 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0423  exported serine protease, trypsin elastase  23.08 
 
 		 323 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0431  putative serine protease  26.32 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.410989  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5498  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.88 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000964373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2859  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.09 
 
 		 279 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4709  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.05 
 
 		 332 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02366  serine protease similarity, trypsin family (Eurofung)  23.75 
 
 		 249 aa  42.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.454558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>