44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_D2825 on replicon NC_007617
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007617  Nmul_D2825  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
314 aa  651    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1254  putative trypsin  27.69 
 
 
548 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000770222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5018  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.28 
 
 
270 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0219219  normal  0.251525 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01372  hypothetical protein  28.89 
 
 
268 aa  63.2  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54319  predicted protein  28.35 
 
 
607 aa  62.4  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004097  secreted trypsin-like serine protease  29.26 
 
 
538 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000141932  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0600  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.67 
 
 
277 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0820  putative trypsin  25.41 
 
 
403 aa  60.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000898339  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2723  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.4 
 
 
552 aa  59.7  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547831  normal  0.0221435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.23 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2105  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.68 
 
 
255 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000698291  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1979  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.91 
 
 
234 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5502  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.24 
 
 
275 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000292489  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1835  serine protease  30.16 
 
 
660 aa  53.1  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5497  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.76 
 
 
272 aa  52.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000909989  normal  0.722104 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40462  predicted protein  28.06 
 
 
508 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.1729  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5818  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.15 
 
 
259 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3593  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.74 
 
 
650 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3469  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.46 
 
 
255 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4968  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.66 
 
 
257 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113067 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5449  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.85 
 
 
366 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114113  normal  0.0272252 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2703  serine protease  26.91 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1429  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.73 
 
 
251 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.321686 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1171  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.64 
 
 
255 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.208534  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1703  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.73 
 
 
251 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333064  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4174  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.29 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5247  hypothetical protein  25.94 
 
 
273 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49602  predicted protein  26.67 
 
 
558 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2873  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25 
 
 
300 aa  46.6  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0332194  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5498  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.08 
 
 
275 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000964373  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5869  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.83 
 
 
247 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3157  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.97 
 
 
249 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0408273  hitchhiker  0.0067091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0425  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.82 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25 
 
 
841 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10090  secreted trypsin-like serine protease  26.29 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.811514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0194  conserved repeat domain protein  25.39 
 
 
543 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1425  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.88 
 
 
248 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.262697 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001191  secreted trypsin-like serine protease  25.14 
 
 
379 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2499  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.52 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.8152 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37254  predicted protein  26.26 
 
 
399 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.65 
 
 
474 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  22.66 
 
 
713 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3037  peptidase M7 snapalysin  24.77 
 
 
392 aa  42.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872515  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0723  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.54 
 
 
254 aa  42.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>