63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1429 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1429  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 251 aa  482  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.321686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1703  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  97.21 
 
 		 251 aa  418  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333064  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1425  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  86.85 
 
 		 248 aa  370  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.262697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4968  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  65.37 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4174  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  59.66 
 
 		 274 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4439  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  60.99 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0387743  normal  0.991895 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0432  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.79 
 
 		 248 aa  142  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.903752 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3469  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.71 
 
 		 255 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1812  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.17 
 
 		 253 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2105  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.64 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000698291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3157  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.13 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0408273  hitchhiker  0.0067091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1171  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.73 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.208534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0650  putative serine protease  34.15 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.06 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1979  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.8 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1704  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.52 
 
 		 282 aa  89  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204445  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1430  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.52 
 
 		 297 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.973827  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1426  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.02 
 
 		 282 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4967  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.19 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147965 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4440  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.09 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.8 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1113  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.15 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5572  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.94 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37254  predicted protein  28.04 
 
 		 399 aa  65.5  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54319  predicted protein  30.24 
 
 		 607 aa  60.1  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5855  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0679921  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02366  serine protease similarity, trypsin family (Eurofung)  26.46 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.454558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5502  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.78 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000292489  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2925  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.63 
 
 		 440 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109953  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.95 
 
 		 557 aa  52.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0149  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 		 227 aa  52.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3593  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.46 
 
 		 650 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2926  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.63 
 
 		 427 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190852  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2924  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 432 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0719819  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0156  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.74 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.839813  hitchhiker  0.000129213 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40462  predicted protein  27.23 
 
 		 508 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.1729  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5869  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.56 
 
 		 247 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.92 
 
 		 474 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49602  predicted protein  26.96 
 
 		 558 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5018  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.64 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0219219  normal  0.251525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5868  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.2 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2825  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.73 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2499  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.62 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.8152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6286  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.47 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343257  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2594  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.35 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5497  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.4 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000909989  normal  0.722104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4609  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.48 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49772  predicted protein  26.88 
 
 		 582 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5498  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.75 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000964373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2275  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.23 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0527  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.71 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.265786 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0828  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.96 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3349  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.11 
 
 		 732 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.185499  hitchhiker  0.0040915 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01372  hypothetical protein  24.57 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1786  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.14 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10090  secreted trypsin-like serine protease  26.57 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.811514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0600  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.11 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004097  secreted trypsin-like serine protease  24.57 
 
 		 538 aa  42.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000141932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5247  hypothetical protein  27.23 
 
 		 273 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0425  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.78 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3119  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.11 
 
 		 732 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449622  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.79 
 
 		 494 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001191  secreted trypsin-like serine protease  22.71 
 
 		 379 aa  42  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>