62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4968 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4968  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 257 aa  488  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4174  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  62.55 
 
 		 274 aa  269  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1703  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  65.16 
 
 		 251 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333064  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1429  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  65.16 
 
 		 251 aa  254  9e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.321686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1425  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  66.82 
 
 		 248 aa  252  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.262697 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4439  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  65.18 
 
 		 272 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0387743  normal  0.991895 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0432  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.11 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.903752 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3469  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.71 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1812  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.04 
 
 		 253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2105  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.53 
 
 		 255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000698291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3157  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.91 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0408273  hitchhiker  0.0067091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0650  putative serine protease  35.63 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1979  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.16 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1171  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.27 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.208534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.61 
 
 		 253 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1430  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.51 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.973827  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1704  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.75 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204445  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1426  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.34 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4967  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.9 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147965 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54319  predicted protein  28.02 
 
 		 607 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4440  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.91 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.84 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1113  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.82 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02366  serine protease similarity, trypsin family (Eurofung)  30.04 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.454558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2924  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.04 
 
 		 432 aa  55.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0719819  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49772  predicted protein  28.74 
 
 		 582 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5572  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.25 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.86 
 
 		 494 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0425  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.03 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2825  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.91 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1830  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.9 
 
 		 465 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37254  predicted protein  27.93 
 
 		 399 aa  49.7  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2925  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.09 
 
 		 440 aa  48.9  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109953  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49602  predicted protein  24.88 
 
 		 558 aa  48.9  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0527  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.48 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.265786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6286  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.17 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5818  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.57 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2723  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.6 
 
 		 552 aa  47  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547831  normal  0.0221435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5502  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.68 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000292489  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40462  predicted protein  28.49 
 
 		 508 aa  45.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.1729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8717  hypothetical protein  29.94 
 
 		 278 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.04 
 
 		 557 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.86 
 
 		 843 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.77 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  hitchhiker  0.0000000383198 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.09 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5498  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.67 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000964373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5247  hypothetical protein  30.09 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004097  secreted trypsin-like serine protease  26.01 
 
 		 538 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000141932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10090  secreted trypsin-like serine protease  29.18 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.811514 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2499  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.9 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.8152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.64 
 
 		 474 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0149  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0723  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.26 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3349  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.85 
 
 		 732 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.185499  hitchhiker  0.0040915 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0156  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.54 
 
 		 227 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.839813  hitchhiker  0.000129213 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2893  hypothetical protein  32.65 
 
 		 272 aa  42.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0812422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5250  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.65 
 
 		 467 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2275  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.88 
 
 		 288 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6487  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.26 
 
 		 300 aa  42.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01372  hypothetical protein  23.87 
 
 		 268 aa  42  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5869  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.02 
 
 		 247 aa  42  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3119  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.88 
 
 		 732 aa  42  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449622  normal  0.355168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>