77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2499 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2499  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 284 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.8152 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.81 
 
 		 269 aa  248  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1017  hypothetical protein  52.17 
 
 		 272 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2677  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.17 
 
 		 266 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.206347 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2893  hypothetical protein  48.64 
 
 		 272 aa  214  9e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0812422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0694  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.6 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0527  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.61 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.265786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  31.98 
 
 		 438 aa  85.9  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3870  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.46 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0562  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.41 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6487  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.67 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1061  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.26 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1812  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.43 
 
 		 253 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6589  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.27 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1062  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.27 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2285  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.34 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.107549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2594  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.75 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1805  S1A family peptidase  28.22 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01567  predicted peptidase  28.22 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01557  hypothetical protein  28.22 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2032  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.22 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1601  S1A family peptidase  28.22 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1784  peptidase, S1A (chymotrypsin) family  28.22 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.718326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1672  S1A family peptidase  28.22 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2308  peptidase, S1A (chymotrypsin) family  28.22 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2045  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.22 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4967  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.17 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147965 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3469  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1979  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.02 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1071  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.37 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0194  conserved repeat domain protein  36.61 
 
 		 543 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01372  hypothetical protein  26.85 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2584  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.86 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.91 
 
 		 474 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0650  putative serine protease  37.8 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1751  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.37 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0231238  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1653  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.33 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2105  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.76 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000698291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3157  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.92 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0408273  hitchhiker  0.0067091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5247  hypothetical protein  34.29 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1585  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.33 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2859  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.37 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1786  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.14 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1689  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.89 
 
 		 273 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.367901  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004097  secreted trypsin-like serine protease  26.46 
 
 		 538 aa  48.9  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000141932  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1928  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.7 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1856  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.89 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2221  putative protease  26.7 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.127855  normal  0.0142716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0600  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.69 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3776  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.19 
 
 		 554 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000930307  unclonable  0.00000981253 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1704  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.98 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204445  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1426  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.98 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8717  hypothetical protein  37.78 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.64 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1430  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.94 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.973827  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5869  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.41 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1429  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.62 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.321686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1594  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.89 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1703  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.62 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333064  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1818  putative protease  26.18 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.276727  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1914  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.11 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1171  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.37 
 
 		 255 aa  47  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.208534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.29 
 
 		 588 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3593  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.37 
 
 		 650 aa  46.2  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2672  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.14 
 
 		 358 aa  45.8  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2618  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.14 
 
 		 358 aa  45.8  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2759  hypothetical protein  27.39 
 
 		 331 aa  45.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.645738  hitchhiker  0.00620663 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0423  exported serine protease, trypsin elastase  29.55 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5572  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.36 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4174  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.8 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5818  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.56 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5497  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.53 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000909989  normal  0.722104 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2825  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.52 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2723  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.48 
 
 		 552 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547831  normal  0.0221435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.67 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  28.46 
 
 		 411 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.17 
 
 		 494 aa  42.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>