45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2285 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2285  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 273 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.107549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2584  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  91.51 
 
 		 284 aa  512  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1786  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  75.18 
 
 		 272 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1751  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  70.44 
 
 		 275 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0231238  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1784  peptidase, S1A (chymotrypsin) family  58.97 
 
 		 273 aa  338  8e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.718326  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1805  S1A family peptidase  58.61 
 
 		 273 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1601  S1A family peptidase  58.97 
 
 		 273 aa  327  9e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1672  S1A family peptidase  58.61 
 
 		 273 aa  326  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2045  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  58.61 
 
 		 273 aa  326  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766167  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2032  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  58.61 
 
 		 273 aa  326  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2308  peptidase, S1A (chymotrypsin) family  58.24 
 
 		 273 aa  325  6e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01567  predicted peptidase  58.24 
 
 		 273 aa  325  6e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01557  hypothetical protein  58.24 
 
 		 273 aa  325  6e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2594  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  60.22 
 
 		 284 aa  322  5e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1914  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.61 
 
 		 273 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1653  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.52 
 
 		 273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1689  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  58.11 
 
 		 273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.367901  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1856  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.74 
 
 		 273 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1585  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.74 
 
 		 273 aa  305  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1594  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.74 
 
 		 273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2221  putative protease  57.49 
 
 		 278 aa  299  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.127855  normal  0.0142716 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1928  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.49 
 
 		 278 aa  299  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1818  putative protease  57.09 
 
 		 278 aa  298  9e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.276727  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1061  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.81 
 
 		 392 aa  96.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1062  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.81 
 
 		 407 aa  92.8  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0587  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.19 
 
 		 444 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0562  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.2 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0527  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.38 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.265786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  28.63 
 
 		 438 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6487  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.93 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2499  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.34 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.8152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6589  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.2 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1017  hypothetical protein  27.93 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.86 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2677  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.37 
 
 		 266 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.206347 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5027  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.83 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3870  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.03 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2893  hypothetical protein  26.52 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0812422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0694  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.1 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4890  peptidase S1, chymotrypsin  25.11 
 
 		 500 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4892  trypsin domain-containing protein  26.2 
 
 		 511 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4967  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.5 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147965 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4335  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.27 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0594008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  25.23 
 
 		 323 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4440  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.42 
 
 		 290 aa  42  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403087  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>