47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2045 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2045  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
273 aa  558  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766167  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2032  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
273 aa  558  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1672  S1A family peptidase  99.63 
 
 
273 aa  557  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01557  hypothetical protein  99.27 
 
 
273 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2308  peptidase, S1A (chymotrypsin) family  99.27 
 
 
273 aa  555  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1601  S1A family peptidase  99.27 
 
 
273 aa  555  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01567  predicted peptidase  99.27 
 
 
273 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1805  S1A family peptidase  99.27 
 
 
273 aa  555  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1784  peptidase, S1A (chymotrypsin) family  98.53 
 
 
273 aa  553  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.718326  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1914  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  76.19 
 
 
273 aa  433  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1585  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  77.57 
 
 
273 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1653  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  77.94 
 
 
273 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1856  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  77.57 
 
 
273 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1689  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  77.94 
 
 
273 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.367901  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1594  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  77.21 
 
 
273 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2594  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  62.64 
 
 
284 aa  339  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2285  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  58.61 
 
 
273 aa  335  5.999999999999999e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.107549  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2221  putative protease  62.69 
 
 
278 aa  329  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.127855  normal  0.0142716 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1928  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  62.31 
 
 
278 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1818  putative protease  61.92 
 
 
278 aa  325  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.276727  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2584  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.72 
 
 
284 aa  322  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1786  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  59.04 
 
 
272 aa  318  6e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1751  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  55.68 
 
 
275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0231238  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1062  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.7 
 
 
407 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1061  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.19 
 
 
392 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0587  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.91 
 
 
444 aa  85.5  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0562  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.57 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6487  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.1 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2499  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.22 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.8152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6589  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.4 
 
 
273 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0694  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.46 
 
 
284 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3870  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.03 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381298  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0527  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.92 
 
 
235 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.265786 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2893  hypothetical protein  24.86 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0812422  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  26.52 
 
 
677 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.13 
 
 
557 aa  46.2  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.71 
 
 
321 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4892  trypsin domain-containing protein  23.91 
 
 
511 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2677  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.07 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.206347 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1017  hypothetical protein  41.07 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  26.67 
 
 
438 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.86 
 
 
721 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  23.31 
 
 
323 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5027  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.75 
 
 
308 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.14 
 
 
269 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4890  peptidase S1, chymotrypsin  26.25 
 
 
500 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  23.31 
 
 
322 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>