49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1928 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1928  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 278 aa  564  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2221  putative protease  99.64 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.127855  normal  0.0142716 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1818  putative protease  99.28 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.276727  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2594  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  64.21 
 
 		 284 aa  357  9e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1805  S1A family peptidase  62.36 
 
 		 273 aa  332  6e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1784  peptidase, S1A (chymotrypsin) family  62.36 
 
 		 273 aa  331  7.000000000000001e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.718326  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1601  S1A family peptidase  62.74 
 
 		 273 aa  323  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2045  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  62.36 
 
 		 273 aa  322  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766167  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2032  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  62.36 
 
 		 273 aa  322  4e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1672  S1A family peptidase  62.36 
 
 		 273 aa  322  4e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2308  peptidase, S1A (chymotrypsin) family  62.36 
 
 		 273 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01567  predicted peptidase  62.36 
 
 		 273 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01557  hypothetical protein  62.36 
 
 		 273 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1786  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  56.09 
 
 		 272 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1914  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.51 
 
 		 273 aa  308  5.9999999999999995e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2285  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  54.21 
 
 		 273 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.107549  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1585  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  56.83 
 
 		 273 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1689  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  58.05 
 
 		 273 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.367901  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1856  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.68 
 
 		 273 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2584  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  54.41 
 
 		 284 aa  300  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1653  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.25 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1594  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.3 
 
 		 273 aa  298  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1751  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  54.58 
 
 		 275 aa  295  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0231238  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1062  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.76 
 
 		 407 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1061  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.04 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0587  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.68 
 
 		 444 aa  82.4  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0562  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.44 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4522  extracellular metalloprotease  26.24 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0902848  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6589  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.1 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0694  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.67 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6487  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.93 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  27.36 
 
 		 438 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4892  trypsin domain-containing protein  24.01 
 
 		 511 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0527  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25 
 
 		 235 aa  52.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.265786 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2036  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.41 
 
 		 278 aa  49.7  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2499  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.7 
 
 		 284 aa  48.9  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.8152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1017  hypothetical protein  27.23 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.242416  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4890  peptidase S1, chymotrypsin  24.04 
 
 		 500 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4335  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.28 
 
 		 294 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0594008  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2677  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.7 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.206347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5959  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.61 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252451  normal  0.94497 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0315  hypothetical protein  42 
 
 		 451 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5027  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.49 
 
 		 308 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4967  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  50 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147965 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3414  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.19 
 
 		 363 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  23.35 
 
 		 269 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3469  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.76 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3475  V8-like Glu-specific endopeptidase-like protein  23.2 
 
 		 305 aa  42.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  26.05 
 
 		 323 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>