39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4335 on replicon NC_014159
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014159  Tpau_4335  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
294 aa  600  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0594008  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.86 
 
 
321 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  32.22 
 
 
322 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  33.76 
 
 
323 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1110  S2 family protease  33.48 
 
 
228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3475  V8-like Glu-specific endopeptidase-like protein  32.74 
 
 
305 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4509  extracellular metalloprotease  35.63 
 
 
175 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000972631 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5027  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.77 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4522  extracellular metalloprotease  34.69 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0902848  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2618  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.83 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2672  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.83 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5547  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.11 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3414  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.51 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  27.78 
 
 
416 aa  72.8  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1107  glutamyl endopeptidase  31.82 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000076539  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1130  glutamyl endopeptidase  31.82 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000101388  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1397  glutamyl endopeptidase precursor SspA  27.19 
 
 
282 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2759  hypothetical protein  28.48 
 
 
331 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.645738  hitchhiker  0.00620663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0587  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.75 
 
 
444 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1200  hypothetical protein  27.81 
 
 
491 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1062  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.5 
 
 
407 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2594  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.98 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  28.57 
 
 
402 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1818  putative protease  45.28 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.276727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  28.81 
 
 
321 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  31.15 
 
 
341 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1928  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.28 
 
 
278 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2221  putative protease  45.28 
 
 
278 aa  46.2  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.127855  normal  0.0142716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.22 
 
 
606 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  29.93 
 
 
393 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1786  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.8 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  28.57 
 
 
363 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  35.11 
 
 
383 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6487  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.67 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  23.35 
 
 
307 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  26.45 
 
 
359 aa  43.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1751  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.15 
 
 
275 aa  42.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0231238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2285  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.27 
 
 
273 aa  42.7  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.107549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  28.24 
 
 
299 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>