61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0620 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  626  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  34.18 
 
 
356 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  33.81 
 
 
349 aa  126  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  32.94 
 
 
383 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  31.23 
 
 
341 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  31.33 
 
 
372 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  31.27 
 
 
318 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  30.6 
 
 
319 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  31.73 
 
 
392 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  30.26 
 
 
293 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  30.6 
 
 
321 aa  99.4  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  27.15 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  28.57 
 
 
361 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  28.85 
 
 
290 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  30.66 
 
 
365 aa  93.2  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  29.01 
 
 
351 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  33.64 
 
 
220 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  26.67 
 
 
371 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  27.78 
 
 
321 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  31.2 
 
 
361 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  27.05 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  30.92 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  26.64 
 
 
328 aa  85.9  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  26.64 
 
 
327 aa  85.5  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  24.33 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  28.75 
 
 
365 aa  84  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  28.3 
 
 
368 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  29.63 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  30.99 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  27.36 
 
 
518 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  32.78 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2447  hypothetical protein  30.29 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.300506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  26.39 
 
 
349 aa  75.9  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  25.1 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  30 
 
 
411 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  34.07 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  24.35 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  25.82 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  31.16 
 
 
506 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  31.48 
 
 
520 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  28.7 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  34.19 
 
 
407 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.27 
 
 
321 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  34.62 
 
 
408 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  27.92 
 
 
359 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  23.72 
 
 
369 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  26.23 
 
 
362 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  34.62 
 
 
316 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  25.81 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  22.03 
 
 
390 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  25.81 
 
 
311 aa  60.1  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  25.99 
 
 
301 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  34.62 
 
 
393 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  23.37 
 
 
365 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  24.69 
 
 
323 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  29.89 
 
 
322 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.04 
 
 
413 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.713533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.12 
 
 
606 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2887  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  46.2  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4335  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.23 
 
 
294 aa  43.5  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0594008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>