43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1847 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  812    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  74.05 
 
 
411 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.69 
 
 
413 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.713533 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  38.95 
 
 
393 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  36.03 
 
 
408 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  36.7 
 
 
316 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  33.02 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  32.56 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  25.6 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  32.57 
 
 
351 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  30.29 
 
 
327 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  37.21 
 
 
341 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  28.27 
 
 
307 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  31.07 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  27.75 
 
 
319 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  25.65 
 
 
363 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  30.69 
 
 
383 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  26.88 
 
 
290 aa  57.4  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  26.49 
 
 
321 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  29.38 
 
 
321 aa  56.2  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  25.37 
 
 
349 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  32.5 
 
 
321 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  26.22 
 
 
341 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  29.67 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  27.23 
 
 
349 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  26.88 
 
 
293 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  28.22 
 
 
343 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  27.78 
 
 
365 aa  49.7  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  31.41 
 
 
352 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  31.01 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  27.59 
 
 
361 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  26.83 
 
 
361 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4335  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 
294 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0594008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  25.25 
 
 
354 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  38.1 
 
 
506 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  25.14 
 
 
372 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  26.54 
 
 
220 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0562  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.66 
 
 
306 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4522  extracellular metalloprotease  34.65 
 
 
306 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0902848  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  24.52 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  25.74 
 
 
392 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  22.91 
 
 
310 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  31.75 
 
 
518 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>