47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1393 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  843    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0009  hypothetical protein  56.72 
 
 		 324 aa  159  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.115503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0518  hypothetical protein  54.48 
 
 		 377 aa  155  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0897  hypothetical protein  52.32 
 
 		 483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  44.83 
 
 		 303 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1519  hypothetical protein  47.1 
 
 		 176 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00366032  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0223  surface antigen  41.55 
 
 		 207 aa  116  8.999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0651  surface antigen  41.38 
 
 		 232 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1630  surface antigen  40.97 
 
 		 290 aa  106  8e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000382803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1708  surface antigen  39.01 
 
 		 256 aa  96.3  9e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.63868  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0110  surface antigen  48.91 
 
 		 152 aa  96.3  9e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2672  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 		 358 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2618  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 		 358 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1614  surface antigen  42.42 
 
 		 144 aa  76.3  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000315849  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  33.76 
 
 		 643 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4335  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.78 
 
 		 294 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0594008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4522  extracellular metalloprotease  28.85 
 
 		 306 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0902848  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5027  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.58 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  35.38 
 
 		 815 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.43 
 
 		 606 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.87 
 
 		 321 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  28.74 
 
 		 808 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5615  hypothetical protein  31.51 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  34.13 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  31.21 
 
 		 595 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.34 
 
 		 693 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  26.52 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1183  hypothetical protein  34.25 
 
 		 633 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0802936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  27.69 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  29.45 
 
 		 514 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.04 
 
 		 638 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1130  glutamyl endopeptidase  26.67 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000101388  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1107  glutamyl endopeptidase  26.67 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000076539  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5547  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.79 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1110  S2 family protease  25 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.26 
 
 		 235 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1864  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.26 
 
 		 235 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.825856  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3108  hypothetical protein  25.44 
 
 		 318 aa  54.3  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133879  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1397  glutamyl endopeptidase precursor SspA  28.63 
 
 		 282 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1861  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.87 
 
 		 239 aa  47  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1896  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.87 
 
 		 239 aa  47  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.52 
 
 		 674 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4509  extracellular metalloprotease  28.57 
 
 		 175 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000972631 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2584  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.87 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3414  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.7 
 
 		 363 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3475  V8-like Glu-specific endopeptidase-like protein  25.91 
 
 		 305 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1786  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  21.88 
 
 		 272 aa  43.5  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>