60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1038 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  649    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  59.07 
 
 
341 aa  326  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  42.12 
 
 
361 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  43.73 
 
 
351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  46.32 
 
 
318 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  40.85 
 
 
321 aa  221  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  40.19 
 
 
310 aa  219  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  43.55 
 
 
319 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  44.55 
 
 
372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  40.13 
 
 
290 aa  209  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  43.25 
 
 
343 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  42.71 
 
 
293 aa  205  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  39.72 
 
 
327 aa  203  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  38.85 
 
 
321 aa  192  8e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  36.36 
 
 
328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  39.12 
 
 
383 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  37.05 
 
 
349 aa  162  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  37.24 
 
 
392 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  32.43 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  31.65 
 
 
365 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  33.02 
 
 
364 aa  122  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  33.65 
 
 
363 aa  122  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  29.2 
 
 
371 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  34.04 
 
 
354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  38.6 
 
 
220 aa  116  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  29.89 
 
 
352 aa  112  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  29.34 
 
 
341 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  30.2 
 
 
368 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  28.03 
 
 
318 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  29.05 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  30.71 
 
 
390 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  27.46 
 
 
365 aa  90.9  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  32.05 
 
 
361 aa  89.7  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  32.96 
 
 
362 aa  89  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  31.84 
 
 
359 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  32.28 
 
 
369 aa  85.9  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  33.33 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  27.78 
 
 
407 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  32.24 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  29.83 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  29.95 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  27.46 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  28.57 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  30.64 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  27.44 
 
 
518 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  26.52 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  26.52 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  26.6 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  28.46 
 
 
506 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  29.52 
 
 
411 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  29.84 
 
 
301 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  27.08 
 
 
520 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  29.38 
 
 
402 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  30.11 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  30.11 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.55 
 
 
321 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4509  extracellular metalloprotease  35.82 
 
 
175 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000972631 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4335  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.81 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0594008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4522  extracellular metalloprotease  31.13 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0902848  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2447  hypothetical protein  31.15 
 
 
259 aa  42.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.300506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>