55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1350 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  790    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  48.4 
 
 		 408 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  45.04 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  34.18 
 
 		 411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  38.95 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.24 
 
 		 413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.713533 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  30.23 
 
 		 364 aa  126  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  31.1 
 
 		 363 aa  126  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  31.98 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  28.78 
 
 		 359 aa  89.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  30.27 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  30 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  31.44 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  30.64 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  29.57 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  29.73 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  27.67 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  30.17 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  31.55 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  28.57 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  31.32 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  29.73 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  28.02 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  29.51 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  25.67 
 
 		 351 aa  67  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  27.37 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  30.85 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  34.55 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  31.18 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  32.45 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  31.43 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  28.18 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  37.61 
 
 		 506 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  27.78 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  27.72 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  33.75 
 
 		 307 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  25.93 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  27.49 
 
 		 365 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  28.46 
 
 		 322 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  28.46 
 
 		 323 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  30.2 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  22.17 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  30.37 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  40 
 
 		 318 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  33.33 
 
 		 372 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  33.98 
 
 		 518 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  36.84 
 
 		 299 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  28.12 
 
 		 369 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  42.19 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  29.33 
 
 		 352 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4335  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.93 
 
 		 294 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0594008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4522  extracellular metalloprotease  27.38 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0902848  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  30.41 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  28.85 
 
 		 520 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0694  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.84 
 
 		 284 aa  44.3  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0786403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>