55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3154 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  747    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  67.86 
 
 		 364 aa  514  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  37.21 
 
 		 318 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  37.44 
 
 		 328 aa  136  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  29.07 
 
 		 327 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  37.56 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  34.76 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  37.09 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  36.11 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  31.39 
 
 		 393 aa  123  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  33.65 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  34.74 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  33.93 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  34.26 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  34.42 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  32.56 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  33.64 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  29.78 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  31.23 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  33.64 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  33.81 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  32.83 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  32.55 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  31.05 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  29.83 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  29.9 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  29.44 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  30.43 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  30.1 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  26.36 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  35.58 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  28.88 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  28.91 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  26.45 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  26.79 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  25.82 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  28.45 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  28.57 
 
 		 365 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  25.1 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  29.34 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  25.65 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  27.6 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  38.71 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  28.11 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  32 
 
 		 520 aa  57  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  29.51 
 
 		 297 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.27 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  31.43 
 
 		 518 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  31.9 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  31.03 
 
 		 323 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  27.59 
 
 		 352 aa  49.7  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  27.06 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4335  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0594008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  28.35 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3704  hypothetical protein  28.28 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0447185 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>