26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3414 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_3414  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
363 aa  755    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1110  S2 family protease  36.59 
 
 
228 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5547  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.34 
 
 
266 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3475  V8-like Glu-specific endopeptidase-like protein  32.44 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  32.26 
 
 
323 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  31.3 
 
 
322 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.28 
 
 
321 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4522  extracellular metalloprotease  29.74 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0902848  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5027  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.33 
 
 
308 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4509  extracellular metalloprotease  34.33 
 
 
175 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000972631 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4335  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.51 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0594008  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2618  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.71 
 
 
358 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2672  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.71 
 
 
358 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.62 
 
 
606 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1397  glutamyl endopeptidase precursor SspA  24.69 
 
 
282 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3108  hypothetical protein  26.96 
 
 
318 aa  51.2  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133879  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2188  hypothetical protein  29.93 
 
 
287 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.602812  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1130  glutamyl endopeptidase  21.55 
 
 
342 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000101388  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1107  glutamyl endopeptidase  21.55 
 
 
342 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000076539  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1300  hypothetical protein  25.35 
 
 
352 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0587  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  23.28 
 
 
444 aa  46.6  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6487  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.14 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  37.7 
 
 
416 aa  44.3  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2221  putative protease  27.19 
 
 
278 aa  43.5  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.127855  normal  0.0142716 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1818  putative protease  27.19 
 
 
278 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.276727  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1928  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.19 
 
 
278 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>