23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1110 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1110  S2 family protease  100 
 
 
228 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3475  V8-like Glu-specific endopeptidase-like protein  60.09 
 
 
305 aa  271  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5547  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.86 
 
 
266 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.44 
 
 
321 aa  162  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  38.77 
 
 
323 aa  138  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  38.84 
 
 
322 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3414  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.59 
 
 
363 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4522  extracellular metalloprotease  39.41 
 
 
306 aa  128  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0902848  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5027  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.39 
 
 
308 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4509  extracellular metalloprotease  38.76 
 
 
175 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000972631 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4335  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.48 
 
 
294 aa  109  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0594008  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2618  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.08 
 
 
358 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2672  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.08 
 
 
358 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.44 
 
 
606 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0315  hypothetical protein  26.74 
 
 
451 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1397  glutamyl endopeptidase precursor SspA  26.29 
 
 
282 aa  58.5  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  25 
 
 
416 aa  57.4  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1130  glutamyl endopeptidase  26.09 
 
 
342 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000101388  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1107  glutamyl endopeptidase  26.09 
 
 
342 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000076539  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1061  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  23.94 
 
 
392 aa  45.8  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  27.27 
 
 
351 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1300  hypothetical protein  26.36 
 
 
352 aa  42.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  31.48 
 
 
341 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>