20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1200 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1200  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  1003    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2759  hypothetical protein  49.11 
 
 		 331 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.645738  hitchhiker  0.00620663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6300  hypothetical protein  41.61 
 
 		 573 aa  180  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0876  peptidase domain protein  41.79 
 
 		 843 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0061  hypothetical protein  47.74 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0122581  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0086  hypothetical protein  47.74 
 
 		 312 aa  167  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0093  hypothetical protein  45.75 
 
 		 331 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1331  hypothetical protein  45.27 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000688358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1915  hypothetical protein  47.3 
 
 		 606 aa  162  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2652  hypothetical protein  42.21 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341914  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4335  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.81 
 
 		 294 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0594008  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2816  serine protease  27.22 
 
 		 348 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1062  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.9 
 
 		 407 aa  48.5  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  30.67 
 
 		 631 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  27.54 
 
 		 741 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  28.66 
 
 		 677 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0562  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.54 
 
 		 306 aa  45.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  29.88 
 
 		 523 aa  43.5  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5247  hypothetical protein  26.58 
 
 		 273 aa  43.5  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5502  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.29 
 
 		 275 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000292489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>