41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4522 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4522  extracellular metalloprotease  100 
 
 		 306 aa  617  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0902848  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.97 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5027  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.42 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1110  S2 family protease  39.41 
 
 		 228 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3475  V8-like Glu-specific endopeptidase-like protein  35.19 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  35.44 
 
 		 323 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  35.65 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4335  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.21 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0594008  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3414  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.74 
 
 		 363 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4509  extracellular metalloprotease  36.96 
 
 		 175 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000972631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5547  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.3 
 
 		 266 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2618  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.18 
 
 		 358 aa  75.5  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2672  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.18 
 
 		 358 aa  75.5  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  28.85 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1818  putative protease  26.13 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.276727  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1928  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.13 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2221  putative protease  26.13 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.127855  normal  0.0142716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.13 
 
 		 606 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  34.13 
 
 		 359 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  33.33 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0315  hypothetical protein  27.52 
 
 		 451 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  29.46 
 
 		 351 aa  49.3  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1130  glutamyl endopeptidase  26.42 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000101388  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1107  glutamyl endopeptidase  26.42 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000076539  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2594  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.31 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  25.83 
 
 		 361 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1062  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.14 
 
 		 407 aa  46.6  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  31.13 
 
 		 321 aa  46.2  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  27.38 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  34.65 
 
 		 402 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1061  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  23.74 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  25.59 
 
 		 349 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3108  hypothetical protein  24.77 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133879  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  28.83 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  26.99 
 
 		 411 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  27.16 
 
 		 354 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  29.03 
 
 		 341 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1397  glutamyl endopeptidase precursor SspA  23.75 
 
 		 282 aa  42.4  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  24.7 
 
 		 327 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  28.12 
 
 		 310 aa  42.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0587  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.83 
 
 		 444 aa  42.4  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>