60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4491 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  743    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  86.19 
 
 
362 aa  633  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  35.92 
 
 
349 aa  106  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  37.65 
 
 
318 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  34.03 
 
 
341 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  33.81 
 
 
363 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  31.84 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  32.77 
 
 
393 aa  89  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  32.28 
 
 
364 aa  85.9  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  33.33 
 
 
341 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  32.23 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  31.11 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  31.46 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  32.54 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  30 
 
 
361 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  33.02 
 
 
402 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  32.41 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  31.98 
 
 
293 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  30 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  33.33 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  29.65 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  29.52 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  32.76 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  29.65 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  43.62 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  32.56 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  32.11 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  30.27 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  30.48 
 
 
372 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  29.32 
 
 
352 aa  63.2  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  25.98 
 
 
371 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  29.25 
 
 
323 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  27.92 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  30.72 
 
 
356 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  29.25 
 
 
322 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.21 
 
 
413 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.713533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  27.8 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4509  extracellular metalloprotease  31.73 
 
 
175 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000972631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  27.18 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4522  extracellular metalloprotease  34.13 
 
 
306 aa  56.6  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0902848  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.23 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  26.41 
 
 
390 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  29.35 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  26.02 
 
 
354 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0527  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.14 
 
 
235 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.265786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  32.26 
 
 
506 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  28.95 
 
 
299 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  27.4 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  31.52 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  27.94 
 
 
365 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  26.62 
 
 
352 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  26.26 
 
 
338 aa  46.6  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3475  V8-like Glu-specific endopeptidase-like protein  27.08 
 
 
305 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  29.6 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  26.26 
 
 
311 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0694  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.24 
 
 
284 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0587  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.25 
 
 
444 aa  43.5  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  25.93 
 
 
369 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4335  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.45 
 
 
294 aa  43.1  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0594008  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2893  hypothetical protein  27.4 
 
 
272 aa  42.7  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0812422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>