60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3908 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  756    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  59.6 
 
 		 372 aa  341  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  46.72 
 
 		 341 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  44.54 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  39.93 
 
 		 351 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  38.56 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  37.14 
 
 		 290 aa  169  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  35.69 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  37.41 
 
 		 319 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  42.33 
 
 		 293 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  34.98 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  39.91 
 
 		 361 aa  159  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  35.4 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  40.76 
 
 		 328 aa  153  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  32.46 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  34.15 
 
 		 321 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  37.28 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  33.83 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  33.08 
 
 		 365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  28.61 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  32.94 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  34.6 
 
 		 352 aa  112  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  28.52 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  34.42 
 
 		 364 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  34.25 
 
 		 356 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  28.57 
 
 		 371 aa  93.2  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  32.55 
 
 		 363 aa  89.7  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  30.56 
 
 		 368 aa  87.8  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  29.84 
 
 		 318 aa  87.4  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  31.75 
 
 		 354 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  34.05 
 
 		 297 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  28.31 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  31.5 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  43.84 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  30.29 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  40.86 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  34.58 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  29.02 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  31.63 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  29.67 
 
 		 411 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  26.76 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  32.11 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  31.58 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  30.69 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  31.44 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  34.83 
 
 		 518 aa  63.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  38.55 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  27.78 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  23.97 
 
 		 365 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  35.29 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  35.29 
 
 		 322 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  25.43 
 
 		 506 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  28.65 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.98 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.713533 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4335  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.11 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0594008  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2447  hypothetical protein  34.31 
 
 		 259 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  22.54 
 
 		 520 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4509  extracellular metalloprotease  34.85 
 
 		 175 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000972631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.04 
 
 		 321 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>