14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4890 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5332  trypsin domain protein  83 
 
 		 510 aa  876    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4890  peptidase S1, chymotrypsin  100 
 
 		 500 aa  1037    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4892  trypsin domain-containing protein  36.21 
 
 		 511 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3783  trypsin domain-containing protein  31.14 
 
 		 517 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1101  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.89 
 
 		 519 aa  60.1  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0521  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.31 
 
 		 542 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1902  hypothetical protein  25 
 
 		 287 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2221  putative protease  24.04 
 
 		 278 aa  47.8  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.127855  normal  0.0142716 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1818  putative protease  24.04 
 
 		 278 aa  47.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.276727  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1928  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.04 
 
 		 278 aa  47.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2285  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.11 
 
 		 273 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.107549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2584  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.55 
 
 		 284 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4945  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.89 
 
 		 514 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1784  peptidase, S1A (chymotrypsin) family  26.25 
 
 		 273 aa  43.5  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.718326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>