56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1101 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1101  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
519 aa  1033    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4945  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  50.4 
 
 
514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0521  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.86 
 
 
542 aa  286  9e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5690  hypothetical protein  36.25 
 
 
298 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.300338  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1902  hypothetical protein  38.49 
 
 
287 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204265  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5959  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.78 
 
 
271 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252451  normal  0.94497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8717  hypothetical protein  34.18 
 
 
278 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5247  hypothetical protein  33.2 
 
 
273 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0600  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.66 
 
 
277 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3037  peptidase M7 snapalysin  32.79 
 
 
392 aa  97.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872515  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0723  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.98 
 
 
254 aa  97.1  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2873  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.33 
 
 
300 aa  95.5  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0332194  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.84 
 
 
260 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  hitchhiker  0.0000000383198 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.42 
 
 
841 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2723  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29 
 
 
552 aa  80.9  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547831  normal  0.0221435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.39 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1835  serine protease  31.22 
 
 
660 aa  75.1  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.24 
 
 
843 aa  73.9  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4892  trypsin domain-containing protein  27.16 
 
 
511 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004097  secreted trypsin-like serine protease  25.47 
 
 
538 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000141932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5869  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.14 
 
 
247 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5332  trypsin domain protein  26.53 
 
 
510 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01372  hypothetical protein  25.11 
 
 
268 aa  65.1  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6286  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.42 
 
 
250 aa  64.7  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343257  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0156  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.52 
 
 
227 aa  64.3  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.839813  hitchhiker  0.000129213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0149  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.88 
 
 
227 aa  63.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0194  conserved repeat domain protein  31.41 
 
 
543 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3783  trypsin domain-containing protein  25.42 
 
 
517 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358948  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2220  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.2 
 
 
307 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231709  hitchhiker  0.00133623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4890  peptidase S1, chymotrypsin  24.89 
 
 
500 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2275  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.2 
 
 
288 aa  58.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37254  predicted protein  25.27 
 
 
399 aa  57.4  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2926  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.88 
 
 
427 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190852  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10090  secreted trypsin-like serine protease  29.39 
 
 
262 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.811514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5875  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.61 
 
 
264 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00114618  normal  0.882563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4627  serine protease  23.53 
 
 
702 aa  56.2  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3480  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.18 
 
 
250 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.59 
 
 
494 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3776  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.72 
 
 
554 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000930307  unclonable  0.00000981253 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3593  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.98 
 
 
650 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004369  secreted trypsin-like serine protease  24.22 
 
 
388 aa  52.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1254  putative trypsin  27.11 
 
 
548 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000770222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5018  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.36 
 
 
270 aa  52  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0219219  normal  0.251525 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001191  secreted trypsin-like serine protease  25.19 
 
 
379 aa  51.6  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.24 
 
 
249 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0425  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.62 
 
 
257 aa  50.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2036  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.29 
 
 
278 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3741  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.44 
 
 
257 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2924  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.77 
 
 
432 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0719819  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2703  serine protease  27.98 
 
 
298 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5502  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.77 
 
 
275 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000292489  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49772  predicted protein  26.94 
 
 
582 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04979  elastase  26.9 
 
 
333 aa  47.4  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5498  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.57 
 
 
275 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000964373  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0828  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.39 
 
 
297 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2859  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.73 
 
 
279 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>