53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0156 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0156  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
227 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.839813  hitchhiker  0.000129213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0149  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  91.19 
 
 
227 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6286  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.87 
 
 
250 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343257  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3480  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.43 
 
 
250 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3741  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.45 
 
 
257 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0723  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.92 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5875  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.56 
 
 
264 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00114618  normal  0.882563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0425  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.78 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3037  peptidase M7 snapalysin  35.02 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872515  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5855  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.49 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0679921  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2873  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.63 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0332194  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8717  hypothetical protein  30.8 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.05 
 
 
260 aa  71.6  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  hitchhiker  0.0000000383198 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4945  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.73 
 
 
514 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5869  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.74 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.2 
 
 
474 aa  69.3  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.3 
 
 
494 aa  68.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1101  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.52 
 
 
519 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5247  hypothetical protein  34.13 
 
 
273 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.523133 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02366  serine protease similarity, trypsin family (Eurofung)  28.51 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.454558 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40462  predicted protein  30.65 
 
 
508 aa  60.1  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.1729  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5502  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.85 
 
 
275 aa  58.9  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000292489  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31 
 
 
249 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2859  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.16 
 
 
279 aa  55.5  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5868  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.52 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3593  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.73 
 
 
650 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2924  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.52 
 
 
432 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0719819  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5959  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.21 
 
 
271 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252451  normal  0.94497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4174  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.02 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3157  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.96 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0408273  hitchhiker  0.0067091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10090  secreted trypsin-like serine protease  28.81 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.811514 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49772  predicted protein  28.69 
 
 
582 aa  49.3  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1703  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.17 
 
 
251 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333064  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5018  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 
270 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0219219  normal  0.251525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1429  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.17 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.321686 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0432  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.24 
 
 
248 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.903752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5818  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.33 
 
 
259 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5498  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.86 
 
 
275 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000964373  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2105  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.17 
 
 
255 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000698291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2925  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.97 
 
 
440 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109953  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2275  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.02 
 
 
288 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2926  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.88 
 
 
427 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190852  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0600  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.67 
 
 
277 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1979  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.02 
 
 
234 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37254  predicted protein  27.23 
 
 
399 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1260  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.38 
 
 
477 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5497  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.31 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000909989  normal  0.722104 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2185  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.72 
 
 
384 aa  42.4  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.523435 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  27.18 
 
 
443 aa  42.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3469  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.43 
 
 
255 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0475  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.9 
 
 
374 aa  41.6  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17019  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1430  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.42 
 
 
297 aa  41.6  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.973827  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1704  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.42 
 
 
282 aa  41.6  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204445  normal  0.237842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>