46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0562 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0562  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 306 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1061  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.99 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3870  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.94 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1062  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2594  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.71 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2893  hypothetical protein  33.67 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0812422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0694  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.82 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6589  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.14 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1914  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.48 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1818  putative protease  31.44 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.276727  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1928  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.44 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2221  putative protease  31.44 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.127855  normal  0.0142716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0587  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.51 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290812 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1786  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.46 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6487  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.22 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1017  hypothetical protein  32.57 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2677  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.6 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.206347 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1751  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.96 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0231238  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1689  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.32 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.367901  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2499  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.41 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.8152 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2285  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.2 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.107549  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1594  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.7 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1585  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.2 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2584  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.04 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1856  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.32 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1805  S1A family peptidase  30.13 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1784  peptidase, S1A (chymotrypsin) family  30.13 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.718326  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1653  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.2 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1601  S1A family peptidase  30.57 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2308  peptidase, S1A (chymotrypsin) family  30.13 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2045  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.13 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766167  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2032  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.13 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01557  hypothetical protein  30.13 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01567  predicted peptidase  30.13 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1672  S1A family peptidase  30.13 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.51 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0527  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.18 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.265786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  30.23 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  25.47 
 
 		 322 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  25 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  39.66 
 
 		 402 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3108  hypothetical protein  27.23 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133879  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1200  hypothetical protein  26.54 
 
 		 491 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5027  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.93 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  32.53 
 
 		 411 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  21.35 
 
 		 416 aa  42.7  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>