12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3108 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3108  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  656    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133879  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1300  hypothetical protein  53.1 
 
 		 352 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3704  hypothetical protein  28.74 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0447185 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1061  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.23 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  25.44 
 
 		 416 aa  54.3  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1062  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.12 
 
 		 407 aa  53.9  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3414  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.96 
 
 		 363 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0315  hypothetical protein  23.91 
 
 		 451 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0587  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.94 
 
 		 444 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2188  hypothetical protein  51.35 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.602812  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0562  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.23 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4522  extracellular metalloprotease  24.77 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0902848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>