13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1300 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1300  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  712    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3108  hypothetical protein  53.1 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133879  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3704  hypothetical protein  30.21 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0447185 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3414  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.96 
 
 		 363 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0587  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.83 
 
 		 444 aa  53.5  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290812 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1061  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.54 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0315  hypothetical protein  25.37 
 
 		 451 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1062  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.88 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  23.35 
 
 		 416 aa  48.9  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1110  S2 family protease  27.63 
 
 		 228 aa  46.6  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2188  hypothetical protein  46.34 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.602812  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0562  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.64 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.82 
 
 		 606 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>