26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3882 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3882  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 511 aa  1028    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405793  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1257  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.59 
 
 		 528 aa  263  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3349  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.07 
 
 		 732 aa  197  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.185499  hitchhiker  0.0040915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3119  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.75 
 
 		 732 aa  194  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449622  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3124  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.62 
 
 		 868 aa  162  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199253  normal  0.898111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1260  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.43 
 
 		 477 aa  146  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1261  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.69 
 
 		 496 aa  146  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1258  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.96 
 
 		 359 aa  143  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4549  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37 
 
 		 690 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0109  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.32 
 
 		 396 aa  113  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1256  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.82 
 
 		 89 aa  57.8  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6818  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.84 
 
 		 276 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.625303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5959  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.38 
 
 		 271 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252451  normal  0.94497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5247  hypothetical protein  27.85 
 
 		 273 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3776  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.76 
 
 		 554 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000930307  unclonable  0.00000981253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0723  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.42 
 
 		 254 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004097  secreted trypsin-like serine protease  25.34 
 
 		 538 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000141932  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2275  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.58 
 
 		 288 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01372  hypothetical protein  24.77 
 
 		 268 aa  47.4  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5572  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.58 
 
 		 259 aa  45.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2189  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.51 
 
 		 261 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.102691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49772  predicted protein  28.57 
 
 		 582 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0194  conserved repeat domain protein  27.44 
 
 		 543 aa  45.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.65 
 
 		 253 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0423  exported serine protease, trypsin elastase  26.32 
 
 		 323 aa  44.3  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1171  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.84 
 
 		 255 aa  43.1  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.208534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>