28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1257 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1257  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
528 aa  1012    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1258  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  81.28 
 
 
359 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1260  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  76.42 
 
 
477 aa  333  5e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1261  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  61.92 
 
 
496 aa  261  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3882  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.97 
 
 
511 aa  253  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405793  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3349  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.27 
 
 
732 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.185499  hitchhiker  0.0040915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3119  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.66 
 
 
732 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449622  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3124  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.52 
 
 
868 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199253  normal  0.898111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0109  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  41.13 
 
 
396 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1256  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  71.59 
 
 
89 aa  117  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4549  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.89 
 
 
690 aa  110  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0194  conserved repeat domain protein  30.69 
 
 
543 aa  53.9  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0055  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.79 
 
 
416 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3157  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.94 
 
 
249 aa  52  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0408273  hitchhiker  0.0067091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0723  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.75 
 
 
254 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2924  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.05 
 
 
432 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0719819  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5869  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.89 
 
 
247 aa  48.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0600  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.33 
 
 
277 aa  47  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5875  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.62 
 
 
264 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00114618  normal  0.882563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2873  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.23 
 
 
300 aa  47  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0332194  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.42 
 
 
557 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_7168  predicted protein  27.03 
 
 
209 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000611936 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2723  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.41 
 
 
552 aa  45.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547831  normal  0.0221435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5818  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.66 
 
 
259 aa  45.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5959  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.09 
 
 
271 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252451  normal  0.94497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2926  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.2 
 
 
427 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190852  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3469  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.74 
 
 
255 aa  43.9  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1979  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.86 
 
 
234 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.532289 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>