44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2415 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 557 aa  1147    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0005  hypothetical protein  41.77 
 
 		 206 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0821  hypothetical protein  40.79 
 
 		 223 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.663641 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0811  N/apple PAN precursor protein  38.16 
 
 		 184 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0251  hypothetical protein  42.86 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1979  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.5 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4596  apple PAN precursor  35.53 
 
 		 172 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0899966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3469  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.77 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49772  predicted protein  26.57 
 
 		 582 aa  61.6  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0891  Apple  35.06 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1171  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.64 
 
 		 255 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.208534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0731  apple domain-containing protein  36.84 
 
 		 191 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33044  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37254  predicted protein  26.05 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54319  predicted protein  29.46 
 
 		 607 aa  57.4  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2105  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.9 
 
 		 255 aa  57  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000698291  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_7168  predicted protein  29.1 
 
 		 209 aa  56.6  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000611936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3066  hypothetical protein  36.56 
 
 		 94 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0460582  normal  0.0415582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1426  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.23 
 
 		 282 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258182 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1704  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.23 
 
 		 282 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204445  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1430  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25 
 
 		 297 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.973827  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2275  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.98 
 
 		 288 aa  53.5  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3593  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.15 
 
 		 650 aa  53.5  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1812  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.44 
 
 		 253 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5572  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.5 
 
 		 259 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1258  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.96 
 
 		 359 aa  49.7  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1784  peptidase, S1A (chymotrypsin) family  25.35 
 
 		 273 aa  47.8  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.718326  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2926  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.32 
 
 		 427 aa  47.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190852  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10090  secreted trypsin-like serine protease  26.79 
 
 		 262 aa  47  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.811514 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1429  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.37 
 
 		 251 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.321686 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1805  S1A family peptidase  25.13 
 
 		 273 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5869  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.64 
 
 		 247 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.35 
 
 		 253 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5451  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.27 
 
 		 338 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal  0.239065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.75 
 
 		 474 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1257  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.42 
 
 		 528 aa  46.2  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0650  putative serine protease  27.16 
 
 		 255 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.19 
 
 		 249 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1703  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.81 
 
 		 251 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333064  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  26.05 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1914  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.6 
 
 		 273 aa  45.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5818  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.73 
 
 		 259 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0527  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.78 
 
 		 235 aa  44.3  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.265786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6300  hypothetical protein  31.58 
 
 		 573 aa  43.9  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5497  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.36 
 
 		 272 aa  43.5  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000909989  normal  0.722104 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>