11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0891 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0891  Apple  100 
 
 		 183 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0811  N/apple PAN precursor protein  75.82 
 
 		 184 aa  278  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4596  apple PAN precursor  76.54 
 
 		 172 aa  269  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0899966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0731  apple domain-containing protein  70.37 
 
 		 191 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33044  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0251  hypothetical protein  57.45 
 
 		 205 aa  217  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0821  hypothetical protein  53.09 
 
 		 223 aa  214  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.663641 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0005  hypothetical protein  61.88 
 
 		 206 aa  208  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.71 
 
 		 557 aa  64.7  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0460  hypothetical protein  36.76 
 
 		 632 aa  49.3  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3066  hypothetical protein  31.52 
 
 		 94 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0460582  normal  0.0415582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3921  hypothetical protein  35.82 
 
 		 1839 aa  42  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.802641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>