14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0460 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0460  hypothetical protein  100 
 
 		 632 aa  1287    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1589  hypothetical protein  26.32 
 
 		 667 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3800  hypothetical protein  28.31 
 
 		 678 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.658534 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1831  hypothetical protein  24.85 
 
 		 711 aa  91.7  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5111  hypothetical protein  28.5 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846979 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04670  conserved hypothetical protein  33.55 
 
 		 881 aa  62.4  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09042  putative alpha 1,3 glucanase, GH71 family (Eurofung)  26.14 
 
 		 642 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.107705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0891  Apple  36.76 
 
 		 183 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0731  apple domain-containing protein  39.71 
 
 		 191 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33044  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01360  mutanase, putative  25.11 
 
 		 614 aa  47.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.399883  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01200  conserved hypothetical protein  27.88 
 
 		 697 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03790  putative alpha 1,3 glucanase, GH71 family (Eurofung)  21.48 
 
 		 493 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.553443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4596  apple PAN precursor  34.78 
 
 		 172 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0899966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0811  N/apple PAN precursor protein  34.78 
 
 		 184 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>