13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1589 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1589  hypothetical protein  100 
 
 
667 aa  1354    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1831  hypothetical protein  51.54 
 
 
711 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3800  hypothetical protein  37.56 
 
 
678 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.658534 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0460  hypothetical protein  26.11 
 
 
632 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5111  hypothetical protein  25.63 
 
 
455 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846979 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04670  conserved hypothetical protein  26.78 
 
 
881 aa  77  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01200  conserved hypothetical protein  26.68 
 
 
697 aa  57  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1017  hypothetical protein  35.51 
 
 
506 aa  54.7  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4327  hypothetical protein  25 
 
 
414 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.885566  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09042  putative alpha 1,3 glucanase, GH71 family (Eurofung)  20.73 
 
 
642 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.107705  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01360  mutanase, putative  23.63 
 
 
614 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.399883  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3007  hypothetical protein  25.5 
 
 
576 aa  48.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03790  putative alpha 1,3 glucanase, GH71 family (Eurofung)  20.81 
 
 
493 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.553443  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>