10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4596 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4596  apple PAN precursor  100 
 
 		 172 aa  352  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0899966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0811  N/apple PAN precursor protein  91.98 
 
 		 184 aa  312  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0891  Apple  76.07 
 
 		 183 aa  269  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0731  apple domain-containing protein  74.07 
 
 		 191 aa  258  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33044  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0005  hypothetical protein  64.12 
 
 		 206 aa  234  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0251  hypothetical protein  62.15 
 
 		 205 aa  231  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0821  hypothetical protein  55.67 
 
 		 223 aa  219  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.663641 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.9 
 
 		 557 aa  64.7  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3066  hypothetical protein  36.76 
 
 		 94 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0460582  normal  0.0415582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0460  hypothetical protein  35.29 
 
 		 632 aa  44.7  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>