13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0005 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0005  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  417  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0251  hypothetical protein  84.47 
 
 
205 aa  350  8.999999999999999e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4596  apple PAN precursor  65.24 
 
 
172 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0899966  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0811  N/apple PAN precursor protein  64.63 
 
 
184 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0821  hypothetical protein  57.81 
 
 
223 aa  221  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.663641 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0731  apple domain-containing protein  60.98 
 
 
191 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33044  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0891  Apple  61.88 
 
 
183 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.77 
 
 
557 aa  67  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3066  hypothetical protein  32.67 
 
 
94 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0460582  normal  0.0415582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0259  alpha-2-macroglobulin-like  35.8 
 
 
1805 aa  45.1  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2412  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.8 
 
 
1557 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  34.33 
 
 
1823 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  34.33 
 
 
1835 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.847476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>