51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4439 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4439  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 272 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0387743  normal  0.991895 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4174  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  72.36 
 
 		 274 aa  326  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4968  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  64.94 
 
 		 257 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1425  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  63.84 
 
 		 248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.262697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1703  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  60.09 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333064  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1429  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  59.64 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.321686 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0432  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.81 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.903752 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2105  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.86 
 
 		 255 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000698291  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3469  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.24 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3157  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.32 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0408273  hitchhiker  0.0067091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0650  putative serine protease  36.05 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1171  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.45 
 
 		 255 aa  118  9e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.208534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1979  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.89 
 
 		 234 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1812  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.78 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1704  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.88 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204445  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1430  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.88 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.973827  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1426  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.47 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.61 
 
 		 253 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4967  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 303 aa  89  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147965 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4440  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.67 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.67 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49772  predicted protein  32.14 
 
 		 582 aa  62.8  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5572  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.58 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0423  exported serine protease, trypsin elastase  25.2 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37254  predicted protein  25.1 
 
 		 399 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10090  secreted trypsin-like serine protease  30.93 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.811514 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001191  secreted trypsin-like serine protease  20.75 
 
 		 379 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54319  predicted protein  25.12 
 
 		 607 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5869  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.52 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2924  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.68 
 
 		 432 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0719819  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6286  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.3 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5250  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.49 
 
 		 467 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6300  hypothetical protein  31.58 
 
 		 573 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1071  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.38 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2825  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25 
 
 		 314 aa  45.4  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2925  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.16 
 
 		 440 aa  45.4  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109953  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.42 
 
 		 474 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9911  peptidase S1 (chymotrypsin) family protein  26.92 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0425  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.71 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1062  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.73 
 
 		 407 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0149  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.83 
 
 		 227 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8717  hypothetical protein  30.54 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1101  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.02 
 
 		 519 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2499  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.52 
 
 		 284 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.8152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5502  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.55 
 
 		 275 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000292489  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0156  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.17 
 
 		 227 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.839813  hitchhiker  0.000129213 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1830  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.47 
 
 		 465 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2873  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.54 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0332194  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.25 
 
 		 249 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02366  serine protease similarity, trypsin family (Eurofung)  24.42 
 
 		 249 aa  42.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.454558 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0527  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.63 
 
 		 235 aa  42.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.265786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>