233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3190 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3190  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 184 aa  378  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.5 
 
 		 487 aa  84.7  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1876  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  31.08 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0146933  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  31.58 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.87 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  33.9 
 
 		 490 aa  74.7  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  33.9 
 
 		 490 aa  72.4  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.78 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  35.59 
 
 		 831 aa  71.6  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1388  conserved hypothetical protein, tetratricopeptide repeat domain protein family  29.27 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  31.3 
 
 		 685 aa  70.1  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6892  Sel1 repeat-containing protein  37.5 
 
 		 363 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0323  beta-lactamase HcpA  31.06 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.742387  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2180  Sel1 repeat-containing protein  29.93 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0570627  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1740  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.59 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000963659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  31.62 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 1032 aa  65.1  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4115  Sel1 family protein  35.58 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0736  beta-lactamase HcpA  25.32 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.519148  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  31.3 
 
 		 1493 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  33.91 
 
 		 680 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  30.25 
 
 		 416 aa  62.4  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  31.97 
 
 		 557 aa  62  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  31.3 
 
 		 373 aa  62  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.37 
 
 		 346 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0589  Sel1 repeat-containing protein  32.77 
 
 		 219 aa  60.8  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4244  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.62 
 
 		 373 aa  61.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  29.36 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  29.82 
 
 		 684 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  29.46 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  35.48 
 
 		 985 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  35.35 
 
 		 505 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  35.48 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4267  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.62 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0418148  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  33.66 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.66 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  33.91 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0247  CoA-binding domain-containing protein  32.77 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1402 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  30.43 
 
 		 373 aa  58.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  30.88 
 
 		 679 aa  58.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  29.37 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  28.44 
 
 		 376 aa  58.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0080  beta-lactamase HcpA  32.5 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141603  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  32.76 
 
 		 536 aa  58.5  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.62 
 
 		 392 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  28.46 
 
 		 305 aa  57.8  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  32.43 
 
 		 961 aa  57.8  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  29.63 
 
 		 267 aa  57.8  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  30.08 
 
 		 913 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  29.27 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.92 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  31.78 
 
 		 464 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  29.52 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  33.04 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 976 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 798 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4273  Sel1 domain-containing protein  30.83 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.194046  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  28.7 
 
 		 763 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  28.21 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2732  Sel1  32.46 
 
 		 307 aa  55.1  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000135758  unclonable  0.000000152447 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  33.01 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0154  Sel1 domain-containing protein  35.37 
 
 		 350 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0876617 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.61 
 
 		 318 aa  55.1  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.46 
 
 		 528 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  34.69 
 
 		 380 aa  54.7  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  28.44 
 
 		 1044 aa  53.9  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  32.69 
 
 		 301 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0097  Sel1  28.95 
 
 		 254 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  28.44 
 
 		 1078 aa  53.9  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.03 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  30 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.03 
 
 		 341 aa  53.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  31.48 
 
 		 415 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  33.62 
 
 		 276 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  32.22 
 
 		 329 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 303 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2145  Sel1 repeat-containing protein  28.21 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000020662  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  29.17 
 
 		 264 aa  52.8  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0462  hypothetical protein  28.21 
 
 		 234 aa  52.4  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  34 
 
 		 425 aa  52.4  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  30.4 
 
 		 1086 aa  52  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  31.25 
 
 		 321 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.8 
 
 		 1261 aa  51.6  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.32 
 
 		 343 aa  51.6  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.85 
 
 		 321 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1693  putative beta-lactamase HcpC (cysteine-richprotein C)  25.16 
 
 		 265 aa  51.6  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1674  hypothetical protein  27.48 
 
 		 338 aa  51.2  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  28 
 
 		 1059 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0991  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.45 
 
 		 239 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.659562  normal  0.202953 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  30 
 
 		 256 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  32.32 
 
 		 384 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.76 
 
 		 1012 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  31.68 
 
 		 478 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4024  Sel1 domain-containing protein  29.9 
 
 		 250 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  27.27 
 
 		 331 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  32.69 
 
 		 482 aa  50.1  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2933  tetratricopeptide TPR_2  37.86 
 
 		 287 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>