50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0647 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0647  Hsp12 variant C  100 
 
 		 161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0080  beta-lactamase HcpA  44.97 
 
 		 169 aa  150  8e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141603  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  28.57 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.48 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0736  beta-lactamase HcpA  36.03 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.519148  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0462  hypothetical protein  30.52 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6892  Sel1 repeat-containing protein  30.77 
 
 		 363 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0323  beta-lactamase HcpA  27.22 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.742387  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0437  hypothetical protein  28.57 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.39 
 
 		 487 aa  58.9  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36 
 
 		 282 aa  57.8  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1544  hypothetical protein  28.57 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72263  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1876  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  31.62 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0146933  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1740  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.79 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000963659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  30.17 
 
 		 393 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  29.57 
 
 		 489 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2145  Sel1 repeat-containing protein  28.21 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000020662  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0126  putative cytochrome c-type haem-binding periplasmic protein  26.22 
 
 		 180 aa  52.4  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.960436  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1388  conserved hypothetical protein, tetratricopeptide repeat domain protein family  33.33 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  27.56 
 
 		 254 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2180  Sel1 repeat-containing protein  27.35 
 
 		 319 aa  48.9  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0570627  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4291  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.33 
 
 		 383 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.233906 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1277  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.17 
 
 		 481 aa  47.4  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  28.44 
 
 		 985 aa  46.2  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.61 
 
 		 341 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3190  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.83 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  26.12 
 
 		 235 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4273  Sel1 domain-containing protein  29.47 
 
 		 284 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.194046  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  25.93 
 
 		 940 aa  45.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0434  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 464 aa  45.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  24.58 
 
 		 233 aa  44.7  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  25.56 
 
 		 685 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  24.68 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  21.62 
 
 		 512 aa  44.7  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 750 aa  44.7  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0628  Sel1  32.97 
 
 		 435 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  25.45 
 
 		 961 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  26.8 
 
 		 838 aa  42.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 859 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1157  ribosomal protein S4  30.3 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.116355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  29.41 
 
 		 255 aa  42.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1037 aa  41.6  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0589  Sel1 repeat-containing protein  27.5 
 
 		 219 aa  41.6  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  23.71 
 
 		 1044 aa  40.8  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  23.71 
 
 		 1078 aa  40.8  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.31 
 
 		 222 aa  40.8  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2038  molybdopterin biosynthesis protein  32.67 
 
 		 136 aa  40.8  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.244571  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 303 aa  40.8  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33 
 
 		 183 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.331928  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4115  Sel1 family protein  27.18 
 
 		 374 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>