97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0628 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0628  Sel1  100 
 
 		 435 aa  893    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0630  Sel1  92.52 
 
 		 432 aa  811    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_003296  RS03736  lipoprotein  63.66 
 
 		 436 aa  555  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.54167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4176  Sel1 domain-containing protein  62.25 
 
 		 412 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0582  TPR repeat-containing protein  65.38 
 
 		 345 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4971  Sel1 repeat-containing protein  47 
 
 		 318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4972  Sel1 repeat-containing protein  44.41 
 
 		 343 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2592  putative lipoprotein  31.72 
 
 		 423 aa  136  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2591  hypothetical protein  30.38 
 
 		 465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853586  normal  0.281141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3861  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.94 
 
 		 451 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2590  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 423 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994803  normal  0.253297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2997  hypothetical protein  29.64 
 
 		 546 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6420  Sel1 domain-containing protein  32.01 
 
 		 520 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111897 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1409  Sel1 repeat-containing protein  32.01 
 
 		 520 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6427  Sel1 domain-containing protein  32.01 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4914 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5678  Sel1 domain-containing protein  31.41 
 
 		 372 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1328  Sel1 domain-containing protein  29.48 
 
 		 548 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.91 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.986909  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2593  putative lipoprotein  30.65 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.866196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3862  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.7 
 
 		 435 aa  106  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67200  hypothetical protein  31.18 
 
 		 289 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00145906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67180  hypothetical protein  30.34 
 
 		 289 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00804523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67210  hypothetical protein  29.48 
 
 		 291 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00555616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4350  Sel1 domain-containing protein  31.79 
 
 		 512 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67190  hypothetical protein  29.02 
 
 		 293 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0024226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  29.55 
 
 		 831 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  28.45 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  30.95 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  33.09 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1493 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  29.65 
 
 		 685 aa  57.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  26.14 
 
 		 2413 aa  57  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  30.99 
 
 		 557 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  27.81 
 
 		 380 aa  55.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  27.32 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  29.29 
 
 		 684 aa  53.5  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 1032 aa  53.1  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1402 aa  52.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  27.14 
 
 		 305 aa  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  27.74 
 
 		 254 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  26.8 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.05 
 
 		 380 aa  51.6  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3443  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.62 
 
 		 248 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  31.91 
 
 		 478 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  29.27 
 
 		 839 aa  50.8  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  25.29 
 
 		 961 aa  50.8  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1929  Sel1 repeat-containing protein  32.63 
 
 		 228 aa  49.7  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.91 
 
 		 565 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.27 
 
 		 528 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3379  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 		 248 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.287446  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00770  conserved hypothetical protein  31.01 
 
 		 763 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.19 
 
 		 798 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.35 
 
 		 328 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  30 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  32.11 
 
 		 789 aa  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  32.87 
 
 		 276 aa  47.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  29.51 
 
 		 232 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  27.03 
 
 		 850 aa  47.4  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00395  hypothetical protein  30.4 
 
 		 455 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0399379  normal  0.95262 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  28.8 
 
 		 448 aa  47  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  29.71 
 
 		 255 aa  46.6  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  31.82 
 
 		 358 aa  46.6  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  30.65 
 
 		 315 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  28.16 
 
 		 552 aa  46.6  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  29.5 
 
 		 209 aa  45.8  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  29.5 
 
 		 490 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2103  Sel1 domain-containing protein  39.02 
 
 		 357 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0952151  normal  0.0177116 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  28.15 
 
 		 693 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  25 
 
 		 1002 aa  45.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0544  hypothetical protein  36.78 
 
 		 1134 aa  45.8  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142127 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 976 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.99 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05223  hypothetical protein  38.67 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0303  hypothetical protein  30.93 
 
 		 190 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.921307  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0479  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.93 
 
 		 190 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0237479  hitchhiker  0.0000406218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.97 
 
 		 321 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0647  Hsp12 variant C  32.97 
 
 		 161 aa  44.3  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4119  Sel1 domain-containing protein  35.44 
 
 		 175 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  30.38 
 
 		 940 aa  44.3  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002265  sodium-type polar flagellar protein MotX  40.82 
 
 		 211 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  25 
 
 		 235 aa  44.3  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1153  Sel1 domain-containing protein  26.78 
 
 		 267 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1095  Sel1 domain-containing protein  27.93 
 
 		 1003 aa  43.9  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  28 
 
 		 241 aa  43.9  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0097  Sel1  25.15 
 
 		 254 aa  43.9  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  31.45 
 
 		 1081 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0993  Sel1 repeat-containing protein  32 
 
 		 232 aa  43.9  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0312  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.63 
 
 		 322 aa  43.5  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 		 272 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  26.83 
 
 		 399 aa  43.5  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3190  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.72 
 
 		 184 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  37.18 
 
 		 274 aa  43.5  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  26.28 
 
 		 380 aa  43.5  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  27.54 
 
 		 705 aa  43.1  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2732  Sel1  22.89 
 
 		 307 aa  43.1  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000135758  unclonable  0.000000152447 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.99 
 
 		 416 aa  43.1  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>