85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1328 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2997  hypothetical protein  67.76 
 
 		 546 aa  781    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4350  Sel1 domain-containing protein  68.62 
 
 		 512 aa  723    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1328  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 548 aa  1129    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2592  putative lipoprotein  57.7 
 
 		 423 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2590  putative lipoprotein  63.93 
 
 		 423 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994803  normal  0.253297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2591  hypothetical protein  54.17 
 
 		 465 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853586  normal  0.281141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2593  putative lipoprotein  55.71 
 
 		 454 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.866196 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6420  Sel1 domain-containing protein  46.6 
 
 		 520 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111897 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1409  Sel1 repeat-containing protein  46.6 
 
 		 520 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6427  Sel1 domain-containing protein  44.38 
 
 		 512 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4914 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5678  Sel1 domain-containing protein  48.31 
 
 		 372 aa  289  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.25 
 
 		 439 aa  285  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.986909  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3861  Sel1 domain protein repeat-containing protein  48.41 
 
 		 451 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3862  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.72 
 
 		 435 aa  233  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4176  Sel1 domain-containing protein  30.47 
 
 		 412 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_003296  RS03736  lipoprotein  32.41 
 
 		 436 aa  127  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.54167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0582  TPR repeat-containing protein  32.44 
 
 		 345 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0630  Sel1  29.89 
 
 		 432 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0628  Sel1  29.48 
 
 		 435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67200  hypothetical protein  30.85 
 
 		 289 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00145906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67180  hypothetical protein  30.82 
 
 		 289 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00804523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67210  hypothetical protein  32.21 
 
 		 291 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00555616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4972  Sel1 repeat-containing protein  29.59 
 
 		 343 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67190  hypothetical protein  30.69 
 
 		 293 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0024226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4971  Sel1 repeat-containing protein  29.19 
 
 		 318 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1493 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  29.44 
 
 		 961 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  27.62 
 
 		 985 aa  56.2  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1402 aa  55.1  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.68 
 
 		 512 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  34.65 
 
 		 552 aa  54.3  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  24.73 
 
 		 831 aa  54.3  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  31.68 
 
 		 464 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  26.85 
 
 		 346 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  32.69 
 
 		 1002 aa  53.1  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.62 
 
 		 565 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  30.72 
 
 		 368 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  31.2 
 
 		 359 aa  50.4  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0025  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 842 aa  50.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000698246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  30.69 
 
 		 328 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.63 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  27.4 
 
 		 684 aa  49.3  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  29.11 
 
 		 505 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  25.95 
 
 		 264 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  27.68 
 
 		 490 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  31.54 
 
 		 232 aa  48.1  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  28.34 
 
 		 357 aa  48.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1358  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.97 
 
 		 258 aa  48.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.177099  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.23 
 
 		 416 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 1032 aa  47.8  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  32.46 
 
 		 329 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  31.86 
 
 		 1081 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  32.61 
 
 		 1134 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  31.52 
 
 		 1105 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  31.25 
 
 		 557 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.77 
 
 		 278 aa  46.2  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  26.32 
 
 		 978 aa  45.8  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  26.11 
 
 		 789 aa  45.8  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  24.23 
 
 		 1430 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  27.27 
 
 		 913 aa  45.8  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  31.68 
 
 		 305 aa  46.2  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 		 599 aa  45.8  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  31.07 
 
 		 1059 aa  45.8  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3098  Sel1 domain-containing protein  35.05 
 
 		 1242 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445363  normal  0.0478733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.62 
 
 		 798 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  27.23 
 
 		 490 aa  45.4  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.6 
 
 		 321 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  32 
 
 		 246 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.39 
 
 		 328 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.62 
 
 		 316 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  27.78 
 
 		 366 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 363 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1366 aa  44.7  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.17 
 
 		 380 aa  44.3  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  32.23 
 
 		 276 aa  44.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  23.26 
 
 		 1141 aa  44.3  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  28.79 
 
 		 241 aa  44.3  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  28.35 
 
 		 185 aa  44.3  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  24.86 
 
 		 705 aa  43.9  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  26.95 
 
 		 376 aa  43.9  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  26.95 
 
 		 376 aa  43.9  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 1196 aa  43.9  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0601  hypothetical protein  33.57 
 
 		 1275 aa  43.5  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.29 
 
 		 1110 aa  43.5  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  31.52 
 
 		 731 aa  43.5  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>