87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2997 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1328  Sel1 domain-containing protein  67.76 
 
 
548 aa  781    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2997  hypothetical protein  100 
 
 
546 aa  1124    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4350  Sel1 domain-containing protein  69.14 
 
 
512 aa  718    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2592  putative lipoprotein  56.48 
 
 
423 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2590  putative lipoprotein  62.72 
 
 
423 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994803  normal  0.253297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2591  hypothetical protein  52.27 
 
 
465 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853586  normal  0.281141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2593  putative lipoprotein  56.14 
 
 
454 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.866196 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1409  Sel1 repeat-containing protein  43.45 
 
 
520 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6420  Sel1 domain-containing protein  43.45 
 
 
520 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.111897 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6427  Sel1 domain-containing protein  42 
 
 
512 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36 
 
 
439 aa  276  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.986909  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5678  Sel1 domain-containing protein  47.03 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3862  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.95 
 
 
435 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3861  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.19 
 
 
451 aa  249  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4176  Sel1 domain-containing protein  31.15 
 
 
412 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67180  hypothetical protein  32.49 
 
 
289 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00804523  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67200  hypothetical protein  32.36 
 
 
289 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00145906  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03736  lipoprotein  28.38 
 
 
436 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.54167  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0628  Sel1  29.64 
 
 
435 aa  120  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0630  Sel1  31.13 
 
 
432 aa  120  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67190  hypothetical protein  33.57 
 
 
293 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0024226  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67210  hypothetical protein  37.7 
 
 
291 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00555616  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0582  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
345 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4972  Sel1 repeat-containing protein  30.25 
 
 
343 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4971  Sel1 repeat-containing protein  31.29 
 
 
318 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30.6 
 
 
1402 aa  67.4  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  32.88 
 
 
1493 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  26.27 
 
 
831 aa  60.5  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.79 
 
 
684 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  30 
 
 
985 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  26.7 
 
 
961 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  29.35 
 
 
264 aa  57  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  30.96 
 
 
490 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.69 
 
 
392 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  31.82 
 
 
789 aa  55.5  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  31.2 
 
 
359 aa  54.7  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  29.34 
 
 
368 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.72 
 
 
318 aa  54.3  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.74 
 
 
416 aa  53.9  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  31.69 
 
 
464 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  29.21 
 
 
346 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  29 
 
 
337 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.53 
 
 
512 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  30.46 
 
 
490 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  24.62 
 
 
489 aa  52.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  34.65 
 
 
552 aa  52.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0025  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
842 aa  51.6  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000698246  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  33.33 
 
 
1002 aa  52  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  35.09 
 
 
685 aa  51.6  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.36 
 
 
363 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  29.78 
 
 
357 aa  50.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 
976 aa  50.4  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  24.75 
 
 
241 aa  49.7  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  30.63 
 
 
208 aa  49.3  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  28.11 
 
 
1366 aa  48.9  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.82 
 
 
380 aa  48.5  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  33.91 
 
 
328 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.14 
 
 
865 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3559  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.45 
 
 
267 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  28.08 
 
 
731 aa  48.1  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  30.38 
 
 
505 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  31.14 
 
 
1877 aa  47.8  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  30.2 
 
 
366 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  27.51 
 
 
373 aa  47.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  30.93 
 
 
329 aa  47  0.0009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  35.37 
 
 
591 aa  47  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.3 
 
 
328 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  34.31 
 
 
202 aa  46.6  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.97 
 
 
278 aa  46.6  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2828  Sel1-like  30.22 
 
 
531 aa  45.8  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0495892  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.8 
 
 
321 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  31.93 
 
 
276 aa  46.2  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  28.18 
 
 
373 aa  45.4  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  27.89 
 
 
305 aa  45.1  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  25.42 
 
 
705 aa  45.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  34.74 
 
 
978 aa  44.7  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3235  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.65 
 
 
267 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.17 
 
 
528 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.97 
 
 
346 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  22.57 
 
 
2413 aa  44.3  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  26.34 
 
 
557 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  32.17 
 
 
329 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  32.61 
 
 
1105 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.35 
 
 
341 aa  43.9  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  32 
 
 
1081 aa  43.5  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1689  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
248 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0199  hypothetical protein  29.08 
 
 
248 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0026614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>