111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2592 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2590  putative lipoprotein  94.74 
 
 
423 aa  729    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994803  normal  0.253297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2591  hypothetical protein  87.94 
 
 
465 aa  778    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853586  normal  0.281141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2592  putative lipoprotein  100 
 
 
423 aa  868    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2593  putative lipoprotein  89.57 
 
 
454 aa  771    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.866196 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1328  Sel1 domain-containing protein  57.7 
 
 
548 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2997  hypothetical protein  56.48 
 
 
546 aa  441  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4350  Sel1 domain-containing protein  70.45 
 
 
512 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.35 
 
 
439 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.986909  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3861  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.56 
 
 
451 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3862  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.1 
 
 
435 aa  302  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1409  Sel1 repeat-containing protein  49.84 
 
 
520 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6420  Sel1 domain-containing protein  49.84 
 
 
520 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.111897 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6427  Sel1 domain-containing protein  48.39 
 
 
512 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4914 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5678  Sel1 domain-containing protein  47.68 
 
 
372 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4176  Sel1 domain-containing protein  31.2 
 
 
412 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0628  Sel1  31.72 
 
 
435 aa  136  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0630  Sel1  31.27 
 
 
432 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_003296  RS03736  lipoprotein  31.42 
 
 
436 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.54167  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0582  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 
345 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67200  hypothetical protein  31.34 
 
 
289 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00145906  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4971  Sel1 repeat-containing protein  31.25 
 
 
318 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67210  hypothetical protein  32.01 
 
 
291 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00555616  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67190  hypothetical protein  33.68 
 
 
293 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0024226  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67180  hypothetical protein  31.07 
 
 
289 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00804523  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4972  Sel1 repeat-containing protein  28.15 
 
 
343 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  29.83 
 
 
684 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  26.26 
 
 
831 aa  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.35 
 
 
512 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  26.94 
 
 
789 aa  62  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  30.11 
 
 
393 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  33.02 
 
 
1002 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  28.65 
 
 
1493 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  27.88 
 
 
1402 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  26.63 
 
 
490 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  32.34 
 
 
961 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  26.13 
 
 
985 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  30.95 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  33.33 
 
 
552 aa  55.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  29.61 
 
 
346 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  26.13 
 
 
490 aa  54.3  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  28.26 
 
 
705 aa  54.3  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  26.95 
 
 
509 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  26.32 
 
 
373 aa  53.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  27.27 
 
 
368 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.42 
 
 
380 aa  52.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  26.95 
 
 
509 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  29.85 
 
 
489 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  29.05 
 
 
357 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  27.22 
 
 
693 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  26.95 
 
 
509 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  26.95 
 
 
509 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.25 
 
 
2413 aa  51.6  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  29.37 
 
 
331 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  29.37 
 
 
331 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  29.37 
 
 
331 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  25.66 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  29.15 
 
 
505 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  22.83 
 
 
865 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  32.08 
 
 
185 aa  50.4  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  29.41 
 
 
557 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
1032 aa  50.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  24.86 
 
 
264 aa  50.1  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31.36 
 
 
1037 aa  50.1  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  28.97 
 
 
231 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  32.14 
 
 
359 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  32.69 
 
 
254 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  25 
 
 
448 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  22.3 
 
 
528 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 
318 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  25 
 
 
271 aa  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  32.74 
 
 
1086 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  36.78 
 
 
365 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  28.08 
 
 
348 aa  47.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  24.71 
 
 
1430 aa  47  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  30.39 
 
 
329 aa  47  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  28.36 
 
 
305 aa  47  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  26.75 
 
 
208 aa  47  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.71 
 
 
363 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  29.53 
 
 
358 aa  46.6  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  28 
 
 
209 aa  46.6  0.0009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  32.09 
 
 
267 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  25.77 
 
 
376 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  25.14 
 
 
685 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  24.28 
 
 
416 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  32.98 
 
 
1081 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  28.46 
 
 
276 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.09 
 
 
321 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.44 
 
 
392 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.4 
 
 
346 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  28.48 
 
 
399 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  25.26 
 
 
376 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  23.29 
 
 
233 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.47 
 
 
282 aa  45.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  30.3 
 
 
246 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 
976 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  23.29 
 
 
1078 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  33.96 
 
 
380 aa  44.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  23.29 
 
 
1044 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  26.9 
 
 
1877 aa  44.3  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0025  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
842 aa  44.3  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000698246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>