77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4971 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4971  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 		 318 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4972  Sel1 repeat-containing protein  72.17 
 
 		 343 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0628  Sel1  47 
 
 		 435 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0630  Sel1  46.37 
 
 		 432 aa  305  9.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0582  TPR repeat-containing protein  47.12 
 
 		 345 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03736  lipoprotein  47.18 
 
 		 436 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.54167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4176  Sel1 domain-containing protein  45.22 
 
 		 412 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2591  hypothetical protein  30.67 
 
 		 465 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853586  normal  0.281141 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6420  Sel1 domain-containing protein  28.82 
 
 		 520 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111897 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1409  Sel1 repeat-containing protein  28.82 
 
 		 520 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1328  Sel1 domain-containing protein  29.19 
 
 		 548 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5678  Sel1 domain-containing protein  29.07 
 
 		 372 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2997  hypothetical protein  31.29 
 
 		 546 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2590  putative lipoprotein  30.59 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994803  normal  0.253297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2592  putative lipoprotein  31.25 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6427  Sel1 domain-containing protein  27.18 
 
 		 512 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4914 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67200  hypothetical protein  29.39 
 
 		 289 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00145906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67180  hypothetical protein  28.04 
 
 		 289 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00804523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3861  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.01 
 
 		 451 aa  96.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.34 
 
 		 439 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.986909  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4350  Sel1 domain-containing protein  31.02 
 
 		 512 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67210  hypothetical protein  27.1 
 
 		 291 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00555616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2593  putative lipoprotein  29.67 
 
 		 454 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.866196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67190  hypothetical protein  28.24 
 
 		 293 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0024226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3862  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.37 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  28.24 
 
 		 831 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  26.74 
 
 		 684 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  24.18 
 
 		 789 aa  52.8  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  25.6 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 		 1032 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  30.17 
 
 		 552 aa  50.8  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  27.34 
 
 		 557 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  26.01 
 
 		 961 aa  50.4  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  25.62 
 
 		 425 aa  50.4  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  33.64 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  22.86 
 
 		 528 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.08 
 
 		 346 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  26.47 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  24.57 
 
 		 2413 aa  48.5  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  28.71 
 
 		 1493 aa  48.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.35 
 
 		 565 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  23.64 
 
 		 399 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  29.08 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  25.95 
 
 		 393 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  26.73 
 
 		 448 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  26.61 
 
 		 255 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  27.78 
 
 		 489 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.85 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  28.71 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1402 aa  46.6  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  25.81 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  29.37 
 
 		 971 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3359  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 		 664 aa  46.2  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49747 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3770  Sel1 domain-containing protein  35.44 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.476398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1521  TPR repeat-domain-containing protein SEL1 subfamily-like protein  25 
 
 		 471 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  hitchhiker  0.000333519 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  27.88 
 
 		 254 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.15 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 971 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  26.92 
 
 		 685 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.83 
 
 		 416 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  28.33 
 
 		 679 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  26.14 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  26.73 
 
 		 185 aa  44.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  28.28 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2103  Sel1 domain-containing protein  28.69 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0952151  normal  0.0177116 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  39.66 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1438  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.39 
 
 		 517 aa  44.3  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.636598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  27.21 
 
 		 586 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0892  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.81 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000556598  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  26.97 
 
 		 680 aa  44.3  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  28.4 
 
 		 384 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  26.81 
 
 		 693 aa  43.9  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  25 
 
 		 246 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  27.52 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 		 705 aa  43.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  29.25 
 
 		 264 aa  42.7  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1281 aa  42.7  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>