44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4972 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4972  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 		 343 aa  706    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4971  Sel1 repeat-containing protein  72.17 
 
 		 318 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03736  lipoprotein  46.57 
 
 		 436 aa  315  7e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.54167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0628  Sel1  44.41 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0582  TPR repeat-containing protein  44.19 
 
 		 345 aa  292  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0630  Sel1  43.53 
 
 		 432 aa  292  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4176  Sel1 domain-containing protein  44.98 
 
 		 412 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1328  Sel1 domain-containing protein  29.59 
 
 		 548 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2997  hypothetical protein  30.25 
 
 		 546 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5678  Sel1 domain-containing protein  30.97 
 
 		 372 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2591  hypothetical protein  29.77 
 
 		 465 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853586  normal  0.281141 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6420  Sel1 domain-containing protein  30.71 
 
 		 520 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111897 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1409  Sel1 repeat-containing protein  30.71 
 
 		 520 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3861  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.18 
 
 		 451 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.39 
 
 		 439 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.986909  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67180  hypothetical protein  28.21 
 
 		 289 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00804523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67200  hypothetical protein  29.01 
 
 		 289 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00145906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67210  hypothetical protein  27.48 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00555616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2592  putative lipoprotein  28.15 
 
 		 423 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2590  putative lipoprotein  28.15 
 
 		 423 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994803  normal  0.253297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3862  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.31 
 
 		 435 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67190  hypothetical protein  28.24 
 
 		 293 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0024226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6427  Sel1 domain-containing protein  30.13 
 
 		 512 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4914 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4350  Sel1 domain-containing protein  29.05 
 
 		 512 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2593  putative lipoprotein  28.43 
 
 		 454 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.866196 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  29.55 
 
 		 490 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 1032 aa  49.7  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.54 
 
 		 380 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3565  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.51 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.98 
 
 		 490 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  24.87 
 
 		 831 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  25.55 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  25.48 
 
 		 557 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  28.57 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  28.47 
 
 		 399 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1281 aa  44.7  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.35 
 
 		 565 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1438  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.37 
 
 		 517 aa  44.3  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.636598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1402 aa  44.3  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  22.89 
 
 		 393 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  26.79 
 
 		 448 aa  43.5  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.3 
 
 		 425 aa  43.5  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  30.48 
 
 		 359 aa  42.7  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>